一度、ファイルに保存する場合
svnadmin dump 【svnディレクトリ】 | svndumpfilter exclude 【消したいsvnパス】 > 【適当なファイル名】
svnadmin create 【svnディレクトリ】
svnadmin load 【svnディレクトリ】 < 【適当なファイル名】
あらかじめ移動先を作っている場合
svnadmin dump 【svnディレクトリ】 | svndumpfilter exclude 【消したいsvnパス】 | svnadmin load 【svnディレクトリ】
例
svnadmin dump C:/SvnRep1 | svndumpfilter exclude /trunk/99_XXX | svnadmin load C:/SvnRep2
参照元